Kegiatan Pembiasaan Harian dan kegiatan penunjang di IIS PSM antara lain Morning Assembly Activites, Sholat dhuha, dhuhur & Ashar berjamaah, Daily Sermon, Hafalan Quran Harian, IIS Fair, Science Day, Market Day, Outbound & Rihlah, Study Excursion, Islamic Camp, Native Speaker Day, Upacara Bendera, Festival Bulan Bahasa, Peringantan Hari besar islam dan Nasional, Sparkling IIS PSM (Graduation, Awarding, Performance) dll.
Adapun kegiatan ektrakurikuler di IIS PSM baik yang wajib dan pilihan antara lain Pramuka, Karate, OSIS, Robotic, Voli, Futsal, Kewirausahaan, Qira’ah, Melukis, Musik, Public Speaking dll.)
Asrama IIS PSM adalah fasilitas yang disediakan oleh sekolah bagi siswa dan siswi IIS PSM (khususnya di jenjang SMP) untuk meningkatkan prestasi belajar siswa khususnya dalam hal ilmu agama dan hafalan Qur’an. Asrama didesain untuk menyiapkan santri yang siap terjun di masyarakat melalui berbagai kegiatan di dalamnya. Asrama bersifat pilihan, siswa SMP tidak wajib tinggal di Asrama karena jumlah santri yang tertampung masih terbatas.
Hafalan Al-Quran, Muhadatsah (Bahasa Arab, Bahasa Inggris), Pengajian Kitab, Qiyamul Lail, Pelatihan Pidato, ceramah dan khutbah (Muhadharah), Banjari & Nasyid Kontemporer dll.